医院科研管理系统包括以下功能模块：课题申报、经费到账管理、课题批文管理、论文投稿登记、论文发表登记、学术著作管理、成果鉴定验收管理、成果获奖管理、成果转化管理、专利管理、学术会议管理、重点实验室管理以及院内奖励和奖励金管理。
课题管理：课题的申报，审核和批准及全过程数据监控。包括专家评审，课题奖励发放情况以及课题中期检查项和课题经费预算和使用，课题衍生成果，课题合同等信息提供给用户和管理员查看。
论文管理：全院用户的论文投稿和论文发表登记审核。
成果管理：包括成果登记,鉴定和验收管理,成果获奖管理以及成果转化管理。
学术著作管理：学术著作发表登记确认
专利管理：专利申请和批准信息登记确认
院内奖励管理：院内获奖流程管理
奖励金管理：奖励金流程,包括课题中标奖,课题津贴,论文奖励金,学术著作奖励金,成果鉴定奖励金,成果获奖奖励金,成果转化奖励金以及专利奖励金
科研考核管理：每个科室人员课题,论文,成果,专著及专利和GCP项目按年度来评分
个人科研中心：快捷显示个人参与的课题,成果,专利,论文等信息,方便查询
科室科研中心：快捷显示科室中每个人参与的课题,成果,专利,论文等信息,方便查询
